广西农业工程职业技术学院是国家教育部备案的专科层次公办高等职业学校，是财政全额拨款的区直公益二类事业单位，由广西壮族自治区人民政府举办，广西壮族自治区农业农村厅建设与管理，教育教学业务接受广西壮族自治区教育厅指导。于2021年3月16日经自治区人民政府同意正式设立，2021年5月10日通过了教育部专科教育高等学校备案，2021年7月9日取得事业单位法人证书。